叶黄素干眼症眼睛疼，可能是由于泪液分泌不足、泪液蒸发过快、眼部炎症等原因所导致。建议患者及时到医院就诊，在医生指导下进行治疗。
1、泪液分泌不足：如果患者长期过度用眼，或者存在糖尿病等全身性疾病，可能会导致泪液分泌不足，从而引起干眼症。当患者长时间看手机、电脑等电子产品时，会加重干眼症的症状，出现眼睛疼痛的情况。此时患者可以遵医嘱使用玻璃酸钠滴眼液等药物进行治疗；
2、泪液蒸发过快：如果患者经常处于高温环境或空气干燥的环境中，会导致泪液蒸发过快，从而引起干眼症。当患者眨眼次数减少时，也会加重干眼症的症状，出现眼睛疼痛的情况。此时患者可以在医生指导下使用聚乙烯醇滴眼液等药物进行治疗；
3、眼部炎症：如果患者不注意眼部卫生，经常用手揉搓眼睛，则容易导致细菌侵入而引起感染，如结膜炎等。当结膜炎发作时，可导致局部充血、水肿，并伴有眼睛疼痛等症状。此时患者可以在医生指导下使用妥布霉素滴眼液等药物进行治疗；
4、其他原因：如果患者本身患有青光眼，则会导致房水循环受阻，使眼球内压力升高而引起青光眼急性发作。当青光眼急性发作时，可导致患者出现眼睛疼痛的情况。此时患者可以在医生指导下使用毛果芸香碱滴眼液等药物进行治疗。
在日常生活中，建议患者注意用眼健康，避免长时间用眼看手机、电脑等电子产品。同时还要注意休息，保证充足的睡眠时间。
