慢性骨髓炎是急性化脓性骨髓炎的延续。往往全身症状大多消失，只有局部引流不畅时，才有全身症状。本病常顽固难治，甚至几年，或者十多年无法治愈。一般来说，在急性期中，经过及时的治疗，患者会痊愈，但是仍有不少患者发生慢性骨髓炎。
慢性骨髓炎的临床表现为进入慢性炎症期时，有局部肿胀，骨质增厚，表面粗糙，压痛。如果窦道，长期不愈的伤口，偶尔的小死骨排出。有时伤口暂时愈合，但由于感染病灶的存在，炎症蔓延，可引起急性发作，有全身寒战发热，局部红肿。切口引流后，或自行穿刺，或药物控制后，全身症状消失，局部炎症也逐渐消退，伤口愈合，故反复发作。
慢性化脓性骨髓炎的治疗一般采用手术、药物的综合疗法。改善全身情况，控制感染和手术治疗的治疗。因重病长期卧床，特别是血源性急性发作后，需要改善全身状况。除了控制感染外，应该加强营养，输血，必要时手术引流等治疗。如有急性复发，应先按照急性骨髓炎治疗，加强应用支持治疗和抗菌药物，必要时切开引流，使急性炎症得到控制。无明显死骨，出现症状只是偶尔，没有局部脓肿或瘘管，是适当的药物疗法和热疗法，休息一个或两个星期后，症状可以不用手术消失。
如果有死骨、鼻窦、空洞、异物等，除了药物治疗外，还应该做手术治疗。术中应改善全身及局部情况，死骨分离，包层已经形成，有足够的新骨，肢体支持重力方可手术。手术原则是彻底清除病灶。包括死骨、异物、鼻窦、感染肉芽组织、疤痕等，术后适当引流可完全治愈骨髓炎。骨髓炎手术一般渗血多，要求尽量在止血带下进行，作好输血准备。
