口腔溃疡不治的危害有内分泌失调、咽喉疾病、癌变风险等。具体分析如下：
1.内分泌失调：口腔溃疡会给患者的生活和工作带来很多的不便，如果还一直的反复发作的话将直接对患者的整个机体的免疫功能造成相当大的影响，危害身体健康。内分泌失调，口腔溃疡极有可能会造成体内的代谢发生紊乱，从而导致内分泌失调，出现发热、头痛、头晕、恶心、无力、视力减退、眼球痛、飞蚊症、淋巴结肿大等全身症状，更有甚者，太过于严重的人还很有可能会导致失明。
2.咽喉疾病：口腔是很重要的，它是用来抵御外界病菌入侵的第一道关卡，也是提前预防咽喉要道出现问题的功臣。往往口腔溃疡发作之后，没有愈合的很快，就会导致细菌病毒就可能通过患处蔓延到咽部引发急性咽喉炎、牙龈炎，导致更严重的疾病。诱发白塞氏病，一个或数个口腔溃疡反复发作甚至此起彼伏，疼痛难忍或伴有其他部位的溃疡(如外阴溃疡)，这种复发性口腔溃疡也要当心癌变得可能。
3.癌变风险：复出现口腔溃疡的危害还有长期经久不愈的口腔溃疡也要当心癌变得可能。如果溃疡直径达1厘米以上，边缘隆起、不整齐，中央凹陷，凹陷的表面有颗粒状的小疙瘩，在溃疡的周围和底部可摸到硬块，就可能是癌变的迹象。若是同一处口腔溃疡，伤口超过三周以上仍未改善，就要警惕是否为发生癌变的信号。
