当患者发生脑疝时，移位的脑组织在小脑幕切痕或枕骨孔中挤压脑干。
脑干受压移位会导致实质性血管牵拉。
严重时，基底动脉进入脑干的中央支会断裂，导致脑干内出血。
出血通常是斑片状的，有时出血可以沿神经纤维方向达到内囊水平。
脑疝患者的症状如下： 1、小脑幕切迹疝 (1)颅内压升高的症状表现为严重头痛和频繁呕吐，其程度比脑疝前更加严重，易怒。
(2)改变意识表现为嗜睡、浅昏迷甚至昏迷，对外界刺激反应迟钝或消失。
(3)瞳孔变化两侧瞳孔不等大。
一开始，病侧瞳孔略有缩小，光反应略有缓慢。
后来，病侧瞳孔逐渐扩大，略有不规则，直接和间接光反应消失，但对侧瞳孔仍然正常，这是由于受影响侧眼神经受到压迫和牵引。
此外，受影响的一侧还可能有眼睑下垂、眼球外斜等。
如果脑疝继续发展，双侧瞳孔会扩大，光反应会消失，这是由于脑干内动眼神经核受压引起的功能障碍。
(4)运动障碍大部分发生在瞳孔扩张的另一侧，表现为肢体的独立活动减少或消失。
脑疝的持续发展使症状影响两侧，导致四肢肌肉力量下降或间歇性头颈背部，四肢挺直，身体背部过度伸展，角弓反向张力，称为大脑矫直，是严重脑干损伤的特征。
(5)生命体征紊乱它表现为血压、脉搏、呼吸和体温的变化。
严重时血压高低，呼吸快慢，有时脸红出汗，有时苍白出汗，体温可高达41℃也可低至35℃最后，呼吸停止，血压下降，心脏停搏死亡。
2、枕骨大孔疝首发症状通常是呼吸暂停，是由于脑干受到挤压影响到呼吸功能，所引起的症状。
通常患者在临终时，有可能会先出现意识障碍，如先出现昏迷，之后逐渐地出现呼吸和心跳停止，最后临床死亡。
